Jasco | CD的全面性探索(下)

CD/ORD應用

CD/ORD應用分為四類:有機化合物光學活性金屬配合物蛋白質和多肽以及核酸





有機化合物(Organic Compounds)

已知光學異構體(Optical Isomers)的識別

對映異構體的CDORD光譜形成完整的鏡像,可以識別光學異構體的配置。圖8展示了α-蒎烯(α-pinene兩種光學異構體的CD光譜。可以看到光譜是垂直對稱的。基於已知配置的光學異構體的ORDCD光譜,可以對具有類似結構的光學活性物質進行分析。


16.png


圖 7 、α-蒎烯(α-pinene)所得 CD光譜圖





通過實證規則(Empirical Rules)分析組態(Configuration)和構形(Conformation

三維環境對發色團Chromophore周圍產生的科頓效應已得到廣泛研究,主要發色團的經驗規則列於表2中。



2、柯頓效應的經驗法則






激子手性方法(Exciton Chirality Method)

如果存在兩個或更多具有強烈Π-Π*帶的等效發色團,並且它們相對於彼此呈非對稱位置,則扭轉方向決定了柯頓效應的符號。這種方法是一種理論上確立的多功能方法,其中不顯示吸收的官能團,如雙醇(2-OH),被衍生為雙苯甲酸酯(圖9)以確定結構組態。


18.png

圖9、α-glycol dibenzoate手性結構組態




金屬配合物(Metal Complexes)

六配位元八面體光學活性配合物

基於與X射線結構分析確定的絕對配置進行比較,已有許多研究對光學活性的六配位八面體配合物進行了探討。圖10展示了一個光學活性配合物的CD/ORD光譜,其中乙二胺與三價鈷離子形成配位。研究的配體包括取代雙胺、氨基酸(Bidentate)、三胺(Tridentate)和EDTA(Hexadentate)配合物。此外,已經對包括Co(III)、Co(II)、Cr(III)、Ru(III)、Rh(III)、Pt(II)、Ir(III)和Ni(II)在內的六配位八面體配合物進行了研究。



圖10、光學活性金屬配合物的ORD、CD和UV光譜




蛋白質和多胜肽(Proteins, Polypeptides)


根據CD光譜,可以估計蛋白質的基本結構,以及α-螺旋(α-helices)、β-折疊(β-sheets)和隨機捲曲的組成比例。圖11展示了Concanavalin ACD光譜。在自然狀態下,它具有豐富的β-折疊結構,但通過氟乙醇(Fluoroethanol, TFE)可以轉化為豐富的α-螺旋結構。圖中顯示了pH值為2的鹽酸溶液中的Concanavalin A50TFE溶液的光譜圖,分別指示了β-折疊和α-螺旋。



圖11 、Concanavalin A的CD光譜圖




核酸(Nucleic acids)

核酸,如具有雙螺旋結構的DNA和參與蛋白質合成的RNA,量測產生的CD光譜圖可反映其結構。其中一個例子是通過CD測量發現左旋ZDNA結構。CD信號的符號是識別左旋和右旋的關鍵。對於核酸來說,最常見的CD測量類型是溫度依賴性測量。可以追蹤核酸雙鏈解開的熔化過程,並根據結構變化來分析熱穩定性。



圖12、DNA解離曲線(左)與DNA雙螺旋結構的熱穩定性(右)





微量取樣(Microsampling)

進行CD測量時,如果使用1 mm的光路長槽座,需要約400 μL的樣品體積。然而,對於非常珍貴的樣品,可以使用微型取樣盤來測量更小的量。只需將樣品滴在已組裝的盤中心的防水塗層區域即可簡單地測量CD光譜(見圖13)。可測量的體積範圍為2 μL(光路長0.2 mm)至10 μL(光路長1 mm)。圖14顯示了牛胸腺(Bovine ThymusDNA溶液10 μL滴量和常規400 μL圓柱細胞(Cylindrical Cell)樣品的結果。可以看到,盡管樣品大小相差40倍,但CD光譜幾乎相同。



圖 13、 樣品裝載



圖14 、牛胸腺DNA的CD光譜圖




使用停流法(Stopped-flow Method)的快速動力學

使用停流法可以追蹤光學活性物質的反應過程。這種方法可用於評估反應速率、短暫中間產物以及反應的抑制劑和促進劑。特別是,它已應用於蛋白質的折疊分析中。利用這種方法在毫秒時間內跟蹤CD信號的變化,可以可視化蛋白質變性和手性分子結構變化。圖15顯示了D-葡萄糖醛酸內酯(D-glucuronolactone)在水性KOH溶液中水解過程中CD信號的變化。

24.png


圖15 、D-葡萄醣醛酸內酯水溶液的水解過程中CD信號變化圖




多樣本篩選(High-throughput CD, HTCD

CD在監測蛋白質結構變化方面的有效性已經有所描述,近年來,除了CD外,同時測量UV吸收和螢光,以及涉及溫度和pH變化的多參數測量已變得普遍。同時,對於許多樣本進行全自動化測量的需求正在迅速增加。為了實現定制的醫療治療,如核酸藥物和抗體藥物,對所需手性分子的篩選是不可或缺的,且CD儀器必須具有高通量測量能力。


jasco-automated-high-throughput-cd

圖16、 高通量 CD 系統




圖 17、光譜 QC 測試程式

        



果您有其他問題,歡迎洽詢尚偉股份有限公司

公司網址 : https://www.sun-way.com.tw/

公司電話 : 02-27718337

公司傳真 : 02-27414646

公司信箱 : mrkt@sun-way.com.tw